怀化市鹤城区少年儿童图书馆的前身是怀化市图书馆少儿分馆，位于怀化市人民南路260号。为满足全市少年儿童求知欲望，培养一代新人，按国务院国办发（1981）62号文件精神的要求---“在中等以上城市和大城市的区都要建立少年儿童图书馆”，根据怀化市编委（1988）4号文件批复，于1988年4月1日正式成立怀化市少年儿童图书馆，单独建制，馆址设人民南路文化山东侧。建馆初，定编3人，总建筑面积459.26平方米。1998年1月，怀化撤地设市，怀化市少年儿童图书馆更名为怀化市鹤城区少年儿童图书馆，并于1999年11月1日搬迁至人民南路260号新馆综合大楼办公。该楼建筑面积共1000平方米。

怀化市鹤城区少年儿童图书馆分设采编部、业务辅导部、外借处、阅览室、活动部等五个部门。现有在职人员16人，其中中级职称6人，初级职称6人。目前馆藏图书48397册，期刊2381册，报纸72种，馆藏文献数据于2008年均已进入ilass系统管理。

2009年，经国家文化部评定为国家三级少年儿童图书馆。

2010年，经与天津市少年儿童图书馆沟通协调，怀化市鹤城区少年儿童图书馆并挂牌为天津市少年儿童图书馆怀化市鹤城区分馆，两套牌子，一套人马，由天津市少年儿童图书馆每年定点捐赠书刊和其他软、硬件方面进行扶持与帮助，以丰富馆藏文献，提高阅读环境，满足读者需求。截止2010年9月，天津市少年儿童图书馆年内已向怀化市鹤城区少年儿童图书馆捐赠书刊8000余册，电脑5台，共价值18万元。